SPARQL Query

Overview

• SPARQL Query
• エントリーページのOverviewの情報を取得するクエリ。

Related Data

Motif

• SPARQL Query
• エントリーページのMotifに関する情報を取得するクエリ。

Monosaccharide composition

• SPARQL Query
• エントリーページのMonosaccharideに関する情報を取得するクエリ。

Linked DB

BCSDB

• SPARQL Query
• エントリーページの糖鎖構造に対して、BCSDB内の糖鎖構造が一致する場合、関連するBCSDB情報を取得するクエリ。

GlycomeDB

• SPARQL Query
• エントリーページの糖鎖構造に対して、GlycomeDB内の糖鎖構造が一致する場合、関連するGlycomeDB情報を取得するクエリ。

GlycoEpitope

• SPARQL Query
• エントリーページの糖鎖構造に対して、GlycoEpitope内の糖鎖構造が一致する場合、関連するGlycoEpitope情報を取得するクエリ。

UniCarb-DB

• SPARQL Query
• エントリーページの糖鎖構造に対して、UniCarb-DB内の糖鎖構造が一致する場合、関連するUniCarb-DB情報を取得するクエリ。
• 本番環境では、未対応

UniCarbKB

• SPARQL Query
• エントリーページの糖鎖構造に対して、UniCarbKB内の糖鎖構造が一致する場合、関連するUniCarbKB情報を取得するクエリ。
• 本番環境では、未対応

PubChem

• SPARQL Query
• エントリーページの糖鎖構造に対して、PubChem内の糖鎖構造が一致する場合、関連するPubChem情報を取得するクエリ。
• テスト番環境では、対応しています。
• 本番環境では、未対応

Glycan Structure from WURCS RDF SEQ

WURCS RDF SEQを利用して、一つのエントリーページにある糖鎖構造の情報を取得する。

• GRES = AccessionNumberが入ったMonosaccharide Residue URI
• SEQ0.3には、GRESのクラスはタイプ付けされてはいない。